研究助成

2022年度 ビジョナリーリサーチ助成(スタート)

遺伝子および転写バリアントの多様性理解に基づく悪性腫瘍のゲノム解析および病態解明

研究題目 遺伝子および転写バリアントの多様性理解に基づく悪性腫瘍のゲノム解析および病態解明
年度/助成プログラム 2022年度 ビジョナリーリサーチ助成(スタート)
所属 千葉県がんセンター 研究所細胞治療開発研究部
氏名 河津 正人
キーワード ロングリードシーケンサー / がんゲノム解析 / 転写バリアント / 前癌病変 / 抗腫瘍免疫
研究結果概要 ロングリードシーケンサーによるゲノム解析技術を活用し、転写バリアントやゲノム配列の多様性に着目したがんの病態解明を進めた。
1. TNS3新規アイソフォームが乳がんの転移に必須であることを示した。新規アイソフォームが細胞接着時のシグナル伝達を制御する分子機構も解明し、論文投稿中である。
2. HLAアレル喪失により前癌病変のがん化が進むことを示した。ヒト白血球抗原(HLA)解析手法を開発し、子宮頸部上皮内腫瘍から子宮頸がんへの進展に、HLAアレル喪失による腫瘍免疫回避が重要であることを明らかにした(提出論文1)。
3. がん細胞の不良ミトコンドリアが腫瘍浸潤リンパ球に水平伝播し、抗腫瘍免疫を減弱させることを発見した。ミトコンドリアDNA変異解析技術を開発し、ミトコンドリアの水平伝播を正確に同定・追跡した (Ikeda, Nature 2025)。
4. ロングリードシーケンス技術を活用した肉腫病理診断法を開発した。特定ゲノム領域を濃縮しつつ配列決定するアダプティブサンプリング技術を活用した肉腫病理診断補助パイプラインを開発し、臨床検体で実証した(提出論文2,3,4)。
公表論文 1. Kawazu M(18/18 authors). Allelic loss of HLA class I facilitates evasion from immune surveillance in cervical intraepithelial neoplasia. HLA 2024,103,e15509.
2. Kawazu M(15/16 authors). Metastasizing aneurysmal dermatofibroma initially diagnosed as angiosarcoma confirmed by CD63::PRKCD fusion gene detection with nanopore sequencing. Genes Chromosomes Cancer 2024,63,e23246.
3. Kawazu M(12/13 authors). Nanopore DNA Sequencing Detected Chromothripsis-Induced PAFAH1B1::USP6 Rearrangement in Periosteal Solid Aneurysmal Bone Cyst Initially Diagnosed as Osteosarcoma. Genes Chromosomes Cancer 2024,63,e23254.
4. Kawazu M(14/15 authors). Fluorescence in situ hybridization-negative intra-articular myxoid liposarcoma with complex rearrangements involving EWSR1::DDIT3 detected using nanopore sequencing. Pathol Int. 2024,74,604-610.
5. Kawazu M(24/25 authors). Somatic mutations in tumor-infiltrating lymphocytes impact on antitumor immunity. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2024,121,e2320189121.