研究助成

2022年度 ビジョナリーリサーチ継続助成(ホップ)

”Microbiome-based Precision Medicine”を見据えた腸内細菌叢の変動に基づく大腸癌発症機構の解明と予防法の創出

研究題目 ”Microbiome-based Precision Medicine”を見据えた腸内細菌叢の変動に基づく大腸癌発症機構の解明と予防法の創出
年度/助成プログラム 2022年度 ビジョナリーリサーチ継続助成(ホップ)
所属 大阪大学大学院医学系研究科 ゲノム生物学講座・がんゲノム情報学
氏名 谷内田 真一
キーワード 大腸癌 / 腸内細菌 / メタゲノム解析 / メタボローム解析
研究結果概要 腸内細菌叢の基づく大腸癌発症機構の解明と予防法の創出を目指し研究を進めている。腸内環境を解析するにあたり「便」の収集とメタゲノム解析を継続している。大腸癌は腺腫を介して、早期癌から進行癌に至る自然史は約20年と推測されている。したがって、通常の散発性大腸癌における腫瘍発症や進展をヒトで証明することは極めて困難である。遺伝的に大腸癌超ハイリスク者である家族性大腸腺腫症(FAP)患者とミスマッチ修復酵素遺伝子の変異を有するLynch症候群患者を対象とした。130人のFAP患者のうち経時的な採便を実施した38症例を対象に検討を行った。FAP患者の多くは腸内細菌の個人差は大きいものの、経時的には細菌組成に変動がみられない患者が多く、腸内細菌組成がダイナミックに変動するFAP患者においては発癌する症例が多いことが明らかとなった。一方で、Lynch症候群患者のうち大腸癌を有する患者に特徴的な細菌はFusobacterium nucleatumのみで、その他の大腸癌関連細菌は検出できなかった。すなわちLynch症候群の大腸癌は腸内細菌の関与は低く、de novoとして発癌する可能性が示唆された。
公表論文 1. Variability in non-tumor areas of colorectal cancer patients as revealed by endoscopic intestinal step biopsies. Mol Cancer. 2024, 23(1):249.
2. Dynamics of the gut microbiome in FAP patients undergoing intensive endoscopic reduction of polyp burden. Gut. 2025, ;74(2):335-338.
3. Leveraging explainable AI for gut microbiome-based colorectal cancer classification. Genome Biol. 2023, 24(1):21.
4. Mediation effect of intestinal microbiota on the relationship between fiber intake and colorectal cancer. Int J Cancer. 2023, 152(9):1752-1762.
5. Cancer as microenvironmental, systemic and environmental diseases: opportunity for transdisciplinary microbiomics science. Gut. 2022; 71:2107-2122.
6. Surgical treatment for colorectal cancer partially restores gut microbiome and metabolome tTraits. mSystems. 2022, ;7(2):e0001822.
7. Comprehensive genomic profiling of neuroendocrine carcinomas of the gastrointestinal system. Cancer Discov. 2022, 12(3):692-711.